27 Nov 2019
Investigadores do grupo GenVip, do Instituto de Investigación de Santiago, coordinado por Federico Martinón-Torres, e Antonio Salas, reciben esta tarde en Vigo o premio internacional Zendal de investigación. O grupo de investigación GenVip (Genetics, Vaccines, Infecctions and Pediatrics Research Group) situado no Hospital Clínico Universitario de Santiago foi recoñecido polo seu labor no ámbito da investigación en enfermidades infecciosas e as vacinas en idade pediátrica. Ao galardón concorrían centros de gran prestixio internacional, como o Consello Superior de Investigacións Científicas (CSIC), o Centro de Bioloxía Molecular Severo Ochoa, Centre for Research in Biological Chemistry and Molecular Materials (CiQUS), Cornea Proyect S.L e o Centro de Investigación en Medicina Molecular e Enfermidades Crónicas (CIMUS). Zendal premia así o seu labor investigador e traslacional. GenVip é un grupo novo e multidisciplinar que integra pediatras, biólogos, xenetistas, farmacéuticos, matemáticos, bioinformáticos, enfermeiros, etc. Nestes últimos dez anos, o grupo de investigación galardoado conseguiu sete macro-proxectos europeos. É, ademais, Centro Colaborador da Organización Mundial da Saúde en Seguridade Vacinal, sendo o único destas características en Europa. O equipo de investigación creou tamén unha unidade de ensaios clínicos de excelencia para vacinas e antiinfecciosos que desenvolveu máis de 70 ensaios clínicos desde Fase 1 que incluíron a máis de 2.000 pacientes galegos. O grupo creou e coordina a Rede Española de Ensaios Clínicos Pediátricos (RECLIP). Ademais, o Servizo de Pediatría do Hospital Clínico Universitario de Santiago onde se integra GENVIP recibiu por segundo ano consecutivo o premio BIC á mellor unidade de infecciosas de España. En palabras do doutor Martinón, “este premio representa un gran estimulo para continuar facendo o que facemos no noso grupo de investigación. Somos un grupo novo e multidisciplinar, pero maduro, no que conflúe unha aposta transgresora do Servizo Galego de Saúde e a Universidade de Santiago a través do Instituto de Investigación Sanitaria de Santiago, coa investigación ao servizo do paciente pediátrico. Cremos que a excelencia asistencial é só posible a través da excelencia investigadora”. A súa proxección no ámbito da produción científica, con máis de 300 traballos e un factor impacto superior a 3.000, enfocada no avance do coñecemento das bases xenéticas das infeccións pediátricas. Segundo o profesor Salas, “abordamos o estudo da bioloxía das enfermidades infecciosas e as vacinas desde o punto de vista das ciencias ómicas, que integran sub-disciplinas como a xenómica, a transcriptómica, a epigenómica e a proteómica. Facemos unha abordaxe integral da bioloxía do hóspede, incluíndo estudos funcionais e de edición xénica, que nos permite deducir os seus patróns de susceptibilidade a distintas patoloxías infecciosas”. A cerimonia de entrega que se celebra hoxe, 27 de novembro, ás 19:00 h na Fundación Barrié de Vigo.
17 Sep 2020
La investigación liderada por los doctores Antonio Salas Ellacuriaga y Federico Martinón Torres concluye que probablemente B3a es el primero linaje del virus que entró en España a través de la ciudad de Vitoria en torno a 11 de febrero de 2020 El virus SARS- Cov-2 entró en España por la ciudad de Vitoria, en torno a 11 de febrero de 2020, a través de la cepa genética B3la. El País Vasco es la comunidad autónoma con más probabilidades de albergar el origen de la pandemia en España, con un foco de expansión importante que tiene lugar entre los días 5 y 14 de aquel mes, así como entre el 16 y el 19 de marzo. Estas son algunas de las conclusiones a las que llegaron los científicos del IDIS Antonio Salas Ellacuriaga y Federico Martinón Torres (jefe del Servicio de Pediatría del Hospital Clínico de Santiago) en un artículo que acaba de ver la luz en la revista Zoological Research y que identifica las cinco cepas genéticas que explicarían el 90% de todos los incidentes en la base de datos de genomas, la práctica totalidad de los casos de la COVID-19 en el territorio español. A2a5, el segundo linaje más importante del virus en España, pudo originarse en Italia, el lugar donde surge su ancestro evolutivo, A2a, a su vez, a más importante a nivel mundial. Esta última llegaría a España a principios de marzo y rápidamente se hace fuerte en Madrid, explican los investigadores. Muchos de estos linajes, ya sean los generados dentro de España, como las importados de fuera, pudieron ser exportados a otros lugares del mundo, como Inglaterra (B3la) o Sudamérica (B3la o La2a4, entre otras). El grupo de investigadores liderado por los investigadores del IDIS, descifró el comportamiento del virus en el Estado. España representa uno de los grandes focos mundiales de la primera onda de la pandemia. Con la finalidad de entenderla desde el punto de vista del agente causal, el equipo de investigadores analizó un total de 41.362 genomas, de los cuales 1.245 componen la muestra española. Este es el mayor estudio global llevado a cabo hasta la fecha en relación con la variabilidad genómica del SARS-CoV-2 en el mundo y el primero publicado en explorar la variación genética en España. B3a, el primer linaje español El presente estudio es una continuación del proyecto pionero previo del mismo grupo de investigación donde los autores descubrieron la importancia de los super-contagiadores cómo gran motor de la pandemia SARS-CoV-2. Esta vez, los científicos centraron sus esfuerzos en comprender la dinámica de transmisión en España. Según este estudio, existen cinco linajes principales que explican casi el 90% de todos los incidentes en la base de datos de genomas: A2a5 (38.4%),  B3a (30.1%),  B9 (8.7%), A2a4 (7.8%), e A2a10 (2.8%). “Mediante una combinación de análisis evolutivos y matemáticos que tienen en cuenta no solo la cronología de los genomas, sino también sus patrones de variación genómica, fuimos capaces de reconstruir el origen más probable de estos linajes, dentro y fuera de España”, explica Antonio Salas. El estudio constata que mientras que B3a, B9 y la sub-linaje A2a5c surgieron en España; A2a5, A2a4 y A2a10 fueron importados de otros países de Europa. Un aspecto distintivo del SARS-CoV-2 en España es la frecuencia tan elevada de genomas pertenecientes a la cepa B: 39.3%; mayoritariamente representadas por las sub-cepas B3a y B9. “En el estudio presentado, se hace una investigación al más puro estilo policial aunando la información que procede de distintas fuentes, básicamente evolutivas, geoespaciales y cronológicas (filogeografía), y ayudándose de la enorme fuente de información allegada por la gran base de datos internacional de genomas utilizada en el estudio”, explican los científicos. En relación con el linaje B3a, y a la luz de los datos existentes en los genomas que componen la muestra, el estudio concluye que el País Vasco es la zona más probable para albergar su origen. Por otro lado, A2a5, el segundo linaje más importante en España “muy probablemente se originó en Italia, otro de los grandes epicentros no asiático en la expansión del coronavirus”, afirman Salas y Martinón. La mutación D614 G es menos frecuente en España Existen ya algunos trabajos que apuntan la que la mutación D614 G en el coronavirus le confiere una mayor capacidad de transmisión. “Nuestro estudio indica que esta mutación está presente en aproximadamente un 56% de todas las cepas de España, lo cual podría parecer muy alta, pero es con todo la más baja de toda Europa (82%)”, señalan. Los resultados de estos investigadores no apoyan una implicación de esta mutación en el alto incidente de la COVID-19 en España, no solamente por su frecuencia que es difícil de encajar con el incidente de la enfermedad, sino también porque la mutación surge en A2 y no A2a; pero es A2a, con todo, “la cepa que tiene éxito a nivel mundial”. Los autores proponen que es el azar, técnicamente deriva génica, favorecido por eventos de super-contagio, lo que eleva la frecuencia de esta mutación en todo el mundo. Los linajes principales de España experimentaron incrementos repentinos en su tamaño efectivo en un tiempo muy corto y en ciudades concretas. El análisis evolutivo de estos linajes delata que detrás de estas expansiones del virus fue necesaria la mediación de super-contaxiadores. Existen varias fuentes de evidencia en relación con este hecho que tienen que ver con la vida media de las cepas de los virus, sus tasas evolutivas, localización geográfica, o cronología, entre otras. “Por todo ello creemos que el papel de los super-contaxiadores y no variaciones ventajosas en el genoma del virus, tuvieron mucha más importancia a la hora de entender y explicar la epidemioloxía del SARS-Cov-2”, dice Martinón. La metodología utilizada por el grupo de Salas y Martinón servirá de modelo para estudiar cualquier otra zona del mundo y demuestra la posibilidad de estudiar la dinámica del virus a escalas geográficas pequeñas cuando se analizan en un contexto pandémico internacional. Este trabajo es solo una parte de un proyecto mucho más ambicioso denominado GEN-COVID, una apuesta que integra genómica, transcriptómica, epixenómica, proteómica e inmunología. El artículo titulado ‘Phylogeography of SARS-CoV-2 pandemic in Spain: a story of multiple introductions, micro-geographic stratification, founder effects, and super-spreaders’ está también firmado por Alberto Gómez Carballa, Xabier Bello Paderne, Jacobo Pardo Seco y María Luisa Pérez del Molino-Bernal.